يتولى مجلس الإدارة مسؤولية تحديد التوجهات العامة ووضع رؤية الهيئة ورسالتها وتحديد أهدافها، كما يتولى الإشراف العام واعتماد الخطط الاستراتيجية ومراقبة الأداء
يرأس المجلس سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان، ممثل الحاكم في منطقة الظفرة بإمارة أبوظبي، ويضم الأعضاء التالية أسماؤهم.