يتولى مجلس الإدارة مسؤولية تحديد التوجهات العامة ووضع رؤية الهيئة ورسالتها وتحديد أهدافها، كما يتولى الإشراف العام واعتماد الخطط الاستراتيجية ومراقبة الأداء
يرأس المجلس سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان، ممثل الحاكم في منطقة الظفرة بإمارة أبوظبي، ويضم الأعضاء التالية أسماؤهم.
سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان
سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان ممثل الحاكم في منطقة الظفرة، رئيس مجلس إدارة هيئة البيئة - أبوظبي
معالي محمد أحمد البواردي
معالي محمد أحمد البواردي
نائب رئيس مجلس الإدارة ورئيس اللجنة التنفيذية لهيئة البيئة
وزير الدولة لشؤون الدفاع
معالي مريم بنت محمد سعيد حارب المهيري
معالي مريم حارب المهيري
وزير التغير المناخي والبيئة
معالي الدكتور مغير خميس الخييلي
رئيس دائرة تنمية المجتمع
معالي فلاح محمد الأحبابي
عضو المجلس
معالي اللواء الركن طيار فارس خلف المزروعي
القائد العام لشرطة أبوظبي
سعادة أحمد صقر السويدي
عضو المجلس
سعادة محمد علي الشرفاء
رئيس دائرة البلديات والنقل
