يتولى مجلس الإدارة مسؤولية تحديد التوجهات العامة ووضع رؤية الهيئة ورسالتها وتحديد أهدافها، كما يتولى الإشراف العام واعتماد الخطط الاستراتيجية ومراقبة الأداء.
سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان
ممثل الحاكم في منطقة الظفرة
رئيس مجلس إدارة هيئة البيئة - أبوظبي
معالي محمد أحمد البواردي
وزير الدولة لشؤون الدفاع
نائب رئيس مجلس الإدارة، رئيس اللجنة التنفيذية لهيئة البيئة – أبوظبي